牙周袋内冲洗能搅乱龈下菌斑微生态，使炎症减轻。主要用于牙周急性炎症的治疗，也可作为洁治和根面平整后的辅助治疗。冲洗时针头只进入龈下2毫米～3毫米，宜选用钝头针，以免刺伤牙龈，冲洗时压力不宜过大。药物在袋内停留的时间较短，需要反复冲洗。常用的药物有3％过氧化氢液、0.1％～0.2％氯己定液。
缓释抗菌药物是当前较新应用的一种局部用药剂型。它是将抗菌药物，如四环素、灭滴灵、氯已定等置入高分子材料制成的微管、薄膜或微囊中，应用时放在牙周袋内，让药物缓慢释放出来，达到抗菌、抑菌的目的。此种用药方式的优点是用药量小，直接作用于患部，大大减少用药剂量，减少了不良反应。目前国际上较为成熟的制剂有2％盐酸米诺环素软膏、25％甲硝唑凝胶、30 9／5氯己定薄片，它们的有效成分可在牙周袋内缓慢释放达7～10天，对牙周病治疗有良好的辅助效果。
含漱药物，它可减少口腔内细菌的数量，对控制牙龈炎有一定的效果。含漱药物维持时间短，需多次含漱，一般每天应漱口4～5次。常用的药物有洗必泰、盐水、双氧水等。
涂布消炎收敛药，在洁治或根面平整后，牙周袋内常涂布消炎收敛药，如碘甘油、碘酚等，它们能除脓、灭菌、止痛、收敛，可使牙周袋变浅。因其刺激性强，组织可形成瘢痕，现已少用。
